日本では古くから、山の神様、田んぼの神様、トイレの神様(厠神)、台所の神様（かまど神）など、米粒の中にも神様がいると考えられてきた。少なくとも古墳時代には、現在の神社につながる自然崇拝の痕跡がある。
『古事記（712年）』には、天照大御神が天岩戸に隠れて世界から光が失われた際に八百万の神が集まって相談したという記述があり、『延喜式（928年）』の『六月晦大祓』には、八百万の神が相談して皇孫が豊葦原ノ瑞穂ノ国を治めるように決定したと書いてある。